Mit Themen der Neuzeit befassen sich neben Einzelpublikationen vor allem wissenschaftlichen Reihen im V&R-Programm. Neben der »Schriftenreihe der Historischen Kommission bei der Bayerischen Akademie der Wissenschaften« sind vor allem die renommierten »Kritischen Studien zur Geschichtswissenschaft« zu nennen. Aber auch die Veröffentlichungen des »Instituts für Europäische Geschichte Mainz«, die Reihe »Religiöse Kulturen im Europa der Neuzeit« sowie die »Rote Reihe« und die »Schriftenreihe der FRIAS School of History« widmen sich der deutschen und europäischen Geschichte des 16. bis 19. Jahrhunderts.
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